近日, 《美國生物化學(xué)雜志》(Journal of Biological Chemistry)發(fā)表了中科院上海生科院營養(yǎng)科學(xué)研究所向嵩研究組的研究論文Structure and function of allophanate hydrolase。該研究解析了脲水解酶(allophanate hydrolase,AH)的三維結(jié)構(gòu),揭示了它催化反應(yīng)的機制。
AH分布于多種微生物中,催化脲(allophanate)到氨的轉(zhuǎn)化。AH與尿素羧化酶(urea carboxylase,UC)構(gòu)成尿素酰胺水解酶(urea amidolyase,UA)復(fù)合物,催化尿素到氨的轉(zhuǎn)化,是多種微生物利用尿素作為它們代謝所需氮源的重要環(huán)節(jié)。尿素是多種含氮的生物分子的代謝產(chǎn)物,使用它為氮源是氮元素在生命圈中的循環(huán)的重要環(huán)節(jié),但有關(guān)AH的三維結(jié)構(gòu)及其在脲(allophanate)催化到氨的具體作用機制尚不清楚。
向嵩研究員指導(dǎo)的博士生研究生樊晨在前期揭示UC的結(jié)構(gòu)和催化反應(yīng)機理的基礎(chǔ)上,通過與營養(yǎng)所尹慧勇組開展合作研究,使用結(jié)晶學(xué)的方法解析了AH的晶體結(jié)構(gòu)。結(jié)果表明:AH由兩個催化結(jié)構(gòu)域構(gòu)成,分別參與兩步催化反應(yīng)中的一步,并揭示了每一步的催化機制。有意思的是,研究發(fā)現(xiàn)其中一步反應(yīng)可能代表一種新穎的脫羧反應(yīng)。該工作不僅促進了人們對對UA的功能機理及微生物吸取尿素作為氮源等的理解,也拓展了對生物脫羧反應(yīng)的認識。
該工作得到了國家科技部和中國科學(xué)院的經(jīng)費資助。